有机产品粮食产量减少转化为森林砍伐的基本前提是有缺陷的。这尤其令人恼火，因为传统农业在世界各地都有大量砍伐森林的历史。工业化农业与自给农业相结合，是最重要的驱动力（链接是外部的）热带和亚热带国家的森林砍伐，根据粮农组织最近的统计数据，  近 90% 的森林砍伐（链接是外部的）. 事实上，有机社区已经花了相当多的时间来反思这个问题，并致力于将原生生态系统保护纳入有机标准：2018 年 4 月，NOSB 通过了一项关于“消除将原生生态系统转化为有机生产”，防止支持本地生态系统的土地从土地用途转变为农业之日起 10 年内获得有机生产认证。如果有人想指责森林砍伐的原因，有机就是转移注意力。

同样重要的是要指出，实际研究只提到与产量集约化相关的有机产品。他们没有考虑区分这两种农业系统的一些关键方面，尤其是在气候变化方面。例如，有机系统和传统系统之间的主要区别之一是有机系统不允许使用基于化石燃料的肥料或大多数合成杀虫剂。这些常规投入的生产和运输（链接是外部的）是主要的能源用途。仅合成肥料的制造就占全球农业排放量的 10%（链接是外部的）. 有机生产方法可显着减少温室气体排放并减少能源消耗（链接是外部的）因为减少使用基于化石燃料的投入。

除了减少温室气体排放外，有机农业还可以通过使用恢复土壤碳储量的土壤管理实践来缓解气候变化（链接是外部的）. 有机农业的核心做法，如更复杂和多样化的作物轮作、使用覆盖作物、整合多年生作物阶段以及使用堆肥或粪肥施肥，有助于形成封闭的养分循环，增加土壤有机碳并创造机会增加碳封存（链接是外部的）.

所有这些并不是说收益率不重要。有机产品增加其环境效益的最重要方式之一是在不减少生态系统保护的情况下提高产量。我们进展顺利——尽管有机研究资金匮乏（例如，目前 95% 的作物品种是为高投入常规管理开发的（链接是外部的），并且可能不太适合有机系统）我们已经看到有机农场的产量增加，这要归功于解决有机农民农场挑战的有限研究。根据加州大学伯克利分校研究人员的一项研究，支持有机实践的研究可以通过使用最佳管理实践和进一步研究进一步减少甚至消除有机农业和传统农业之间的产量差距。有机部门已经看到了用于克服有机生产挑战的少量资金的好处，并且一些研究发现最佳管理实践可以产生与传统生产相当的产量。