吸收过程
胃肠道吸收：PQQ 主要在小肠吸收。在摄入含有 PQQ 的食物或补充剂后，它会随着食物的消化过程在胃肠道内被逐步释放。PQQ 是一种小分子有机化合物，其化学结构有利于它在胃肠道的吸收环境中通过肠壁进入血液循环。它可能通过被动扩散的方式吸收，即顺着浓度梯度从肠道腔进入肠上皮细胞。这一过程类似于其他小分子营养物质的吸收方式，不过具体的吸收机制还在进一步研究中。
影响吸收的因素：食物成分可能会对 PQQ 的吸收产生影响。例如，脂肪类食物可能会促进 PQQ 的吸收，因为一些脂溶性成分可以与 PQQ 相互作用，增加其在肠道中的溶解性和稳定性，从而提高吸收效率。另外，肠道的生理状态，如肠道微生物群落的组成和活性，也可能在一定程度上影响 PQQ 的吸收。健康的肠道微生物环境可能有助于 PQQ 的分解和转化，使其更容易被人体吸收。
代谢途径
细胞内代谢：吸收后的
PQQ 进入血液循环，随后被运输到各个组织和器官的细胞中进行代谢。在细胞内，PQQ 会参与一系列的氧化还原反应。它作为一种辅酶，能够与多种酶相互作用，参与细胞的能量代谢和其他生物化学反应。例如，PQQ 可以通过其氧化还原活性中心与氧化还原酶结合，在电子传递过程中发挥作用。在这个过程中，PQQ 自身的化学结构可能会发生变化，它会接受和提供电子，从而完成氧化还原循环。
肝脏代谢：肝脏是人体重要的代谢器官，PQQ 也会在肝脏中进行代谢。在肝脏中，PQQ 可能会经历一些酶促反应，如与葡萄糖醛酸结合等反应。这些结合反应可以改变 PQQ 的化学性质，使其更容易被排出体外。肝脏中的细胞色素 P450 酶系也可能参与 PQQ 的代谢过程，对其进行氧化、还原或其他化学修饰。
排泄途径
尿液排泄：PQQ 及其代谢产物主要通过尿液排出体外。在肾脏中，血液经过滤过、重吸收和分泌等过程，PQQ 代谢产物会随着尿液排出。尿液中 PQQ 及其代谢产物的含量可以反映人体对 PQQ 的代谢情况，通过检测尿液中的 PQQ 相关物质，可以了解 PQQ 在体内的代谢速度和程度。
粪便排泄：部分 PQQ 或其代谢产物也可能通过粪便排出。这可能是因为在肠道中，未被吸收的 PQQ 或者经过胆汁排泄到肠道中的 PQQ 代谢产物会随着粪便排出体外。胆汁是肝脏分泌的一种液体，其中含有多种代谢产物，PQQ 代谢产物也可能通过胆汁进入肠道，然后随粪便排出。